(修業4年，符合畢業資格，授予學士學位)招收一年級新生暨二、三年級轉學生
航運管理學系進修學士班航管組
航運管理學系進修學士班資管組
航運管理學系進修學士班物流管理組
食品科學系進修學士班
商船學系進修學士班
輪機工程學系進修學士班
(修業1.5年，符合畢業資格，授予學士學位)招收一年級新生
商船學系學士後多元專長培力課程專班
輪機工程學系學士後多元專長培力課程專班
(修業1~4年，符合畢業資格，授予碩士學位)招收一年級新生
商船學系碩士在職專班
航運管理學系碩士在職專班航運管理組
航運管理學系碩士在職專班企業管理組
航運管理學系國際物流管理碩士在職專班
運輸科學系運輸與供應鏈管理碩士在職專班
輪機工程學系碩士在職專班
食品科學系碩士在職專班
食品安全管理碩士在職學位學程
環境生物與漁業科學學系碩士在職專班
海洋環境資訊系碩士在職專班
河海工程學系碩士在職專班
電機工程學系碩士在職專班
資訊工程學系碩士在職專班
教育研究所碩士在職專班
海洋法律研究所碩士在職專班